CDD Ingénieur en développement logiciel “Connectomist & microstructure”

Le centre NeuroSpin est un centre de neuroimagerie pariant sur l’utilisation des très hauts
champs magnétiques pour décoder la structure et le fonctionnement du cerveau humain. La
compréhension de la connectivité anatomique du cerveau est centrale pour décoder
l’organisation des divers réseaux fonctionnels (du langage, de la lecture, de la vision, de
l’audition, du calcul, …), et le centre NeuroSpin a développé une expertise en IRM de diffusion
qui permet à la fois de reconstruire et reconnaître automatiquement les faisceaux de fibres de
la substance blanche constituant les autoroutes de l’information dans le cerveau,
mais aussi de mesurer l’organisation locale du tissu à l’échelle cellulaire, pour par exemple
mesurer le diamètre axonal moyen, la densité des axones, ….

Cette recherche s’est appuyée depuis une dizaine d’années sur le développement d’un outil
logiciel, Connectomist, et le poste d’ingénieur CDD
proposé vise à doter l’équipe de développement d’une ressource dont les missions seraient:

– l’intégration des nouveaux modèles biophysiques du processus de diffusion développés par
les chercheurs du centre NeuroSpin à des fins de décodage de l’organisation du tissu cérébral à
l’échelle cellulaire (ie microscopie par IRM de diffusion),
– le développement de nouveaux pipelines dédiés à l’analyse de données acquises dans le
cadre de projets de recherche clinique menés au sein de NeuroSpin et en partenariat avec des
collaborateurs extérieurs centrés sur la microscopie par IRM de diffusion,
– une participation au développement de l’interface graphique du logiciel,
– d’assurer un rôle d’interlocuteur avec les utilisateurs pour recenser leurs besoins et préparer le
développement de nouvelles fonctionnalités en réponse aux besoins exprimés, toujours en lien
avec les techniques de microscopie IRM de diffusion.

Durée: le poste ingénieur est ouvert en CDD pour une durée d’1 an. Le poste est à pourvoir dès
à présent.

Diplômé d’une grande université ou d’une grande école

Le candidat devra avoir suivi un cursus en traitement du signal ou de l’image, et maîtriser les outils de programmation dans les langages C++ et python. Il devra également avoir des connaissances en visualisation 3D (OpenGL) et une bonne maîtrise du toolkit graphique Qt. Des connaissances en imagerie médicale et en physique de l’IRM seront appréciées. Enfin, le candidat doit savoir travailler en équipe dans un cadre pluridisciplinaire à l’interface avec des physiciens, des cliniciens et des experts en traitement de l’image.

CEA NeuroSpin